地形以丘陵山地為主。寧都縣屬贛南中低山丘陵區(qū)，總體地勢西、北、東三面高，中間低，自北向南依次下降。境內(nèi)北部多山，中部丘陵起伏。西、北部邊界為雩山山脈，地勢較高；東部屬武夷山山脈的分支，連綿不斷；中、南部是丘陵、崗地及縱貫?zāi)媳钡拿方記_積平原。地貌形態(tài)總體呈“一河二屏”的自然地理格局。地貌以丘陵、山地為主，全縣有丘陵1407平方公里，占總面積的34.73%；山地1788平方公里，占總面積的44.13%。境內(nèi)海拔一般為300米至500米，最高點(diǎn)位于西北部的凌云山，海拔1454.9米；最低處是南部黃石鎮(zhèn)下車坪村，海拔154米。
河流眾多水系發(fā)達(dá)。寧都縣屬于長江流域贛江水系源頭區(qū)域，境內(nèi)河網(wǎng)密布，有大小河流638條。全縣流域面積20平方公里以上河流65條，其中：200平方公里以上的有8條，50平方公里以上的有34條，河網(wǎng)密度為每平方公里0.68公里。主要河流有梅江、琴江、青塘河、黃陂河、固厚河、會同河、琳池河等。梅江河發(fā)源于寧都北部，自北向南流經(jīng)11個鄉(xiāng)鎮(zhèn)，境內(nèi)河道全長145公里，流域面積近3000平方公里，是贛江水系面積最廣、長度最長、徑流量最大的支流。境內(nèi)有小二型以上水庫116座，其中大（2）型水庫1座（團(tuán)結(jié)水庫），中型水庫2座（竹坑水庫、老埠水庫）。
